Está (o estaba) dividida en dos secciones bien separadas, por un lado el hospital, y por otro la iglesia propiamente dicha.
La edificación data del siglo XVII, cuando la Hermandad de la Santa Caridad de Nuestro Señor Jesucristo necesitaba un lugar donde llevar a cabo su labor asistencial, que era la principal.
Desde ese momento, la hermandad comenzó a realizar sus labores estatuarias en las nuevas dependencias, llevándose a cabo, además, un gran número de misas, sobre todo hasta 1721, debido al cumplimiento de cláusulas testamentarias.
La hermandad de la Caridad gastó 4.000 reales en blanquear el edificio para tal ocasión.
En 1976, se cedió el edificio a la Agrupación de Cofradías de Málaga y más tarde se cerró para ser adecuado y restaurado.