Se graduó de la Philadelphia High School for Girls en 1884.
En 1890, completó su disertación de tesis Über Protoplasma-Strömung im Pflanzenreich (Acerca del flujo protoplasmático en el reino vegetal) recibiendo el doctorado.
[6] Tuvo un hermano, Harry Frederick Keller, químico, que también enseñó en escuelas públicas de Filadelfia.
[2] En los años previos a la aprobación de la Decimonovena Enmienda, Keller era activa en el movimiento por el sufragio femenino.
[2] Durante 32 años, continuó enseñando y tuvo una silla en el Departamento hasta su jubilación en 1930[8].