Fue creada en 1906 de la fusión del Club botánico de la American Association for the Advancement of Science (fundada en 1893), de la Society for Plant Morphology and Physiology (fundada en 1896) y de la American Mycological Society (fundada en 1903).
Los miembros iniciales son científicos de los Estados Unidos y del Canadá.
En la actualidad, pertenecen a más de ochenta naciones diferentes.
Se han sucedido dieciocho directores de la publicación hasta la actualidad, el último de ellos Karl Joseph Niklas (1948-).
En 1955, la Sociedad comenzó a publicar el Plant Science Bulletin, revista interna dirigida por Harry Fuller (desde 1958).