Kakunyo fue el primer monje jefe de Hongan-ji, y se dedicó a la alabanza del Buda Amida.

Hongan-ji ganó por primera vez poder e importancia en el siglo XV, cuando Rennyo se convirtió en el octavo monje jefe.

La secta Tendaishū, que tenía su base en el monte Hiei, vio esta expansión como una amenaza y atacó a Hongan-ji tres veces por medio de sus monjes guerreros.

Aunque el templo ya no es por lo tanto, oficialmente, Higashi Hongan-ji, la mayoría le sigue llamando de esta forma.

El kura (倉, almacén) reúne varios tesoros nacionales, la mayor parte de los cuales no se encuentran a la vista del público.