El sitio arqueológico fue identificado con la Troya homérica desde el siglo XIX, aunque permanecen numerosas incertidumbres.En otra parte de Anatolia hay abundantes evidencias arqueológicas de una cultura Neolítica floreciente al menos de 7000 años a. C. Podría haber sido el primer asentamiento urbano en todo el mundo (datado en 6500 a. C.), y ha sido descubierto en Çatalhöyük en el Konya Ovasi (Konya Basin).Homero, sin embargo, no fue contemporáneo de esta historia.En la Ilíada, la palabra más comúnmente usada para la ciudad de los troyanos no es Troya sino Ilión.Al menos un grupo de griegos los situaron en un lugar llamado Teutrania en el área conocida como Misia.
Las murallas del castillo de Troya VI con los restos de la torre en el lado este del complejo