Primero, fue un miembro destacado del Partido de Acción Democrática, el mismo de Izebegović, renunció en 1996 para formar el Partido por Bosnia y Herzegovina (SBIH).

[4]​ Silajdžić expresó su desacuerdo con el fallo, pero destacó el hecho que la corte afirmó que Serbia y Montenegro había violado la Convención del Genocidio, al no impedir o castigar a los perpetradores del genocidio.

[5]​ Silajdžić integró la delegación bosnia que negoció en los Acuerdos de Dayton, mediado por Estados Unidos.

En primer lugar, afirmó que dicho documento fue esencial en el término del genocidio en Bosnia y Herzegovina, pero luego lo percibió como un obstáculo en la reunificación del país.

Con el fin de anular ciertos puntos del acuerdo, Silajdžić se opuso directamente a la constitución política del país, lo que causó controversia, célebre para los bosniacos mas no para los serbobosnios.