Fue el único de los 19 acusados en el juicio Dora que fue condenado a muerte.
Allí cometió los delitos que llevarían a su juicio y ejecución.
Richard Baer (comandante de Auschwitz) y su personal se hicieron cargo del complejo Dora, y Möser fue puesto como nuevo líder adjunto, esta vez bajo Franz Hössler.
Los prisioneros fueron conducidos luego en una marcha de la muerte y asesinados.
En su declaración durante el juicio, Möser dijo: Möser fue encontrado culpable, y fue el único acusado en el juicio Dora que resultó condenado a muerte.