El conflicto careció de un patrón principal o una estructura armada estándar.

Los primeros enfrentamientos entre la población armenia y los azeríes tuvieron lugar en Bakú, en febrero de 1905.

Pronto, el conflicto se extendió a otras partes del Cáucaso, y el 5 de agosto de 1905 estalló el primer conflicto entre la población armenia y la azerí, que se desarrolló en Shusha.

Al mismo tiempo, la Comuna de Bakú se involucró en combates con el Ejército Otomano del Cáucaso, que avanzó y sitió Gəncə.

El Ejército del Islam otomano y sus aliados azeríes, dirigidos por Nuri Pasha, entraron en Bakú el 15 de septiembre y asesinaron entre 10 000-20 000 armenios como represalia por la masacre de los musulmanes en marzo.

Por orden del General Thomson, se aplicó la ley marcial en Bakú.

[6]​ En agosto, se creó un gobierno independiente en Shusha, el centro administrativo de la región.

Los conflictos armados entre estas unidades continuaron hasta el Armisticio de Mudros.

[7]​ En el Armisticio de Mudros General Andranik fue traído para ver la posibilidad de crear una base para una mayor expansión hacia el este y formar un corredor estratégico con Nakhichevan,[7]​ En enero de 1919 las tropas armenias avanzaron hacia Shusha, donde capturaron y destruyeron 9 aldeas azeríes en su camino, pero finalmente tuvieron que retirarse.

Andranik retiró sus unidades de mando y los británicos en Bakú cedieron el control al Dr Khosrov Bek Sultanov.

La intensidad de los combates aumentó en febrero de 1920 y se implantó la ley marcial en Karabaj, que entró en vigor por el recién formado Ejército Nacional, dirigido por el general Samedbey Mehmandarov.

En el oeste, los armenios seguían ocupando gran parte del territorio azerí, en el este, los comunistas locales azeríes se rebelaron contra el gobierno, y en el norte de Rusia el Ejército Rojo estaba constantemente en movimiento hacia el sur, después de haber derrotado a las fuerzas rusas blancas de Denikin.

Frente a una situación tan difícil, el gobierno se entregó oficialmente a los soviéticos, pero muchos de los generales y de las milicias locales azerí resistieron al avance de las fuerzas soviéticas, y se hacía un tiempo para que los soviéticos estabilizaran a la recién proclamada República Socialista Soviética de Azerbaiyán, encabezada por El líder bolchevique azerí Nariman Narimanov.

Otros territorios capturados en la zona incluyeron Najicheván y gran parte del distrito de Kazajo-Shamshadin.

Reorganizaron las líneas soviéticas y al ejército azerí, que fue equipado de nuevo pero con armas rusas.

Sin embargo, las fuerzas turcas no pudieron derrotar totalmente a Armenia, y después de su derrota, cerca de Ereván, Turquía firmó el alto el fuego.

A finales de noviembre, hubo otro levantamiento comunista en Armenia respaldado por los soviéticos.