Las tribus Quillacingas habitaron el actual territorio gualmatense por al menos tres mil años.

Las hordas incaicas alcanzaron el sur de Nariño a mediados del siglo XV.

El Inca Huayna Capac gobernó esta zona entre 1483 y 1525, creando los ayllus de Yaesnan, en lo que hoy es Gualmatán, y Champutis, en lo que hoy es el corregimiento de Cuatis.

Para 1550, el Capitán Alonso de Ahumada asume la encomienda que abarca desde Camellones hasta el páramo Rucio (Paja Blanca).

Los jesuitas heredan la encomienda que pasa a manos del Capitán Diego de Benavides en 1589.

En 1890 Gualmatán es derogado a corregimiento, sin embargo en 1892 se le devuelve su categoría de municipio, estatus que conserva en la actualidad.

Casi el 40 % de sus habitantes (2251) viven en la cabecera municipal y el resto (3531) en la zona rural.

Gualmatán es un municipio esencialmente agrícola, se cultiva papa, maíz, frijol, alverja, ulloco, haba, trigo, cebada, cebolla, ajo, repollo, lechuga, tomate de árbol, curuba, mora, reina claudia, brócoli, uvilla, mortiño, pera, zanahoria, manzana y diversas platas ornamentales.

La telefonía móvil tiene una alta popularidad, mientras que la penetración del servicio de Internet va en aumento.

El municipio cuenta con 4 automotores para el transporte de carga hacia Ipiales, Pasto y el centro del país.