El Gran Premio de San Marino de 2006 fue una carrera de automovilismo disputada el 23 de abril de 2006 en el Autodromo Enzo e Dino Ferrari de la ciudad de Imola, Italia, siendo la cuarta fecha de la Temporada 2006 de la Fórmula 1.

Lo más destacado de la carrera fue el terrible vuelco de Christijan Albers en la primera vuelta y el duelo Michael Schumacher contra Fernando Alonso (calcado al del año anterior pero con las posiciones cambiadas) con victoria para el español.

Este fue el último Gran Premio de San Marino en la Fórmula 1, y la última carrera en el circuito de Imola antes de 2020.