Si bien no fue reconocido durante mucho tiempo y no tuvo poder efectivo tras la Segunda Guerra Mundial, siguió existiendo hasta el final del gobierno comunista en Polonia en 1990, cuando delegó formalmente sus responsabilidades al nuevo gobierno.

[cita requerida] Nombró entonces al general Władysław Sikorski como primer ministro y comandante en jefe de las Fuerzas Armadas polacas.

Los otros gobiernos aliados, por razones diplomáticas, aceptaron formalmente la excusa soviética, pero el Gobierno de Polonia en el Exilio rehusó hacerlo.

Sikorski, ampliamente reconocido como el líder exiliado polaco más capaz, resultó muerto en un misterioso accidente aéreo, imputado por algunos historiadores a agentes británicos o soviéticos, en Gibraltar en julio de 1943.

[cita requerida] Lo sucedió como cabeza del Gobierno de Polonia en el Exilio Stanisław Mikołajczyk.

[1]​ El historiador Antony Polonsky observó que la actitud de los militares nacionalistas polacos ante el genocidio judío fue compleja y más controvertida.

Se determinó evitar la acción militar prematura y conservar su fuerza (y armas) para la confrontación crucial para el ejército local, los judíos no eran parte de 'nuestra nación'[cita requerida] y ... no se tomarían medidas para defenderlos si ponía en peligro otros objetivos [del Ejército del Interior] " fueron acusados de haber podido hacer mucho para ayudar a los judíos.

[2]​ Durante la ocupación nazi unos 200.000 judíos fueron asesinados directa o indirectamente en la Segunda Guerra Mundial, muchas de las víctimas judías perecieron por las acciones de la llamada Policía Azul creada por el Gobierno General en la Polonia ocupada por la Alemania nazi.

Una parte se opuso a la continuidad del Presidente August Zaleski en su cargo cuando expiró su mandato de siete años.

Algunos volvieron finalmente a Polonia, como el primer ministro Hugon Hanke en 1955 y su predecesor Stanisław Mackiewicz en 1956.

En 1992 fueron reconocidas oficialmente en Polonia las medallas militares y otras condecoraciones otorgadas por el Gobierno en el Exilio[cita requerida]