A principios del siglo XIX la administración de Siberia fue reformada, y la gobernación de Irkutsk cedió una parte de su territorio a las nuevas entidades creadas.

Después de la guerra civil rusa la gobernación se reorganizó, pasando de cinco a tres distritos y después abolida.

Su territorio pasó a formar entonces parte del krai de Siberia (1925-1930).

[1]​ El territorio del gobierno de Irkutsk corresponde principalmente a la actual óblast de Irkutsk.

Al principio del siglo XIX, la gobernación de Irkutsk estaba dividido en 5 distritos: Balagansk, Verjolensk, Irkutsk, Kírensk y Nizhneúdinsk.