El Giro de Lombardía 2006, la 100.ª edición de esta clásica ciclista, se disputó el sábado 14 de octubre de 2006, con un recorrido de 256 km entre Mendrisio y Como.
Paolo Bettini se llevó por segunda ocasión consecutiva la clásica lombarda pocos días después de la muerte de su hermano en un accidente de coche.
Samuel Sánchez (Euskaltel-Euskadi) y Fabian Wegmann (Gerolsteiner) le acompañaron en el podio.