Juan Francisco nació en la noble familia de los Pico, su padre era Galeoto Pico, hermano del famoso humanista y escritor Giovanni Pico della Mirandola, y su madre era María, hija de Scipion Deste.
Estaba convencido de que cultura clásica y el catolicismo eran incompatibles.
Niega la validez de los silogismos y del individualismo.
Para Pico el fundamento de la fe es la revelación y no la demostración.
Entre ellas resaltan dos biografías, la primera sobre su tío, el humanista y filósofo Giovanni Pico della Mirandola, y otra sobre el fraile dominico Girolamo Savonarola, esta última de estilo apologético.