Entre 1948 y 1958, Franju realizó trece cortometrajes que le encumbraron como maestro del documental francés.

[1]​ Alcanzó la fama en 1949 con el documental corto llamado Le sang des bêtes (La sangre de las bestias).

Es más conocida su película de terror Les yeux sans visage (Los ojos sin rostro, 1960), de la que Pauline Kael dijo que era «quizás la película de terror más elegante que se haya hecho jamás», con Pierre Brasseur, Edith Scob y Alida Valli.

En 1965 Franju fue utilizado, sin saberlo, por los servicios secretos de Marruecos para tender una trampa al opositor Mehdi Ben Barka.

Un falso productor, Georges Figon, le propuso realizar un documental sobre la descolonización con el asesoramiento de Ben Barka.