Además de adentrarse en las situaciones privadas del profesor, la serie también se enfocaba en algunos estudiantes como Gabriela «Gaby» (Diana Ángel), Magdalena (Verónica Orozco), Elkin (Manuel José Chávez), Carlos «Caballo» (Óscar Mauricio Rodríguez), Marcela (Lina María Luna), Fernando «Fercho» (Jorge Monterrosa), Jhonatan «Jhon David» (Jacques Toukhmanian), entre otros.
[20] Para Francisco, dictar clases en un colegio distrital se hizo complicado debido a las actitudes rebeldes de algunos estudiantes, que en algunos casos terminaban en peleas.
[21] Cada temporada de la serie, fue equivalente a un año lectivo académico, es decir entre 1999 y 2001 se desarrolló la serie cuyos estudiantes cursaban noveno (Educación básica secundaria), décimo y undécimo grado (Educación media vocacional).
Al desconocerse que la serie iba a durar varias temporadas más, su actor principal Luis Mesa salió de la serie en 2000 para trabajar en otras producciones, y fue reemplazado por el actor Ricardo Vélez bajo el nombre de Juan Francisco Reyes.
Los productores decidieron mantener la esencia original de profesor integral, salvo que este dictaba clases de español y literatura, y esto no fue impedimento para que la serie se siguiera llamando Francisco El Matemático.
En 2004 se emitió la sexta temporada, aunque no tuvo mucho éxito y decidieron cancelar la serie.
Son personajes que sólo estuvieron una temporada El # de capítulos es basado en Versión Internacional En sus primeras fechas se llamó Francisco: Clase 2004, pero a los pocos meses retomó su nombre original.
Personajes menores que actuaron esporádicamente durante una temporada específica al llegar a Bogotá.