Gracias a la gran amistad que tiene Carlos Bilardo desde que compartieron en Cali, este le consiguió unas pasantías y reforzó sus conocimientos viendo los entrenamientos del para aquel momento también debutante como entrenador Miguel Ángel Russo y el consolidado Bambino Veira.
Club que dirigió en la temporada 1987, remplazando al argentino Norberto Claudio Bautista quien falleció ejerciendo el cargo, volvió en 1989, con aceptables resultados.
En diciembre de 2014, llegó para cumplir con su tercer ciclo en la institución; y consiguió su segundo título como entrenador al obtener el Torneo Apertura 2015.
Sin embargo, la pésima participación en la Copa Libertadores 2016, y la irregular campaña en el torneo local, tuvo por consecuencia su salida del equipo.
En la temporada 2000, clasificó al cuadrangular final que definió el campeón del año; ocupó el cuarto lugar.
Regresó seis años después al banquillo cardenal, y participó en los cuadrangulares semifinales del Torneo Apertura 2008.
Disputó un cupo a la final en el Torneo Finalización, y no pasó de Primera Ronda en la Copa Sudamericana.