En la India construyó las fortalezas portuguesas de Anjadip, Cananor y Cochín.

Fue criado en la corte del rey Alfonso V de Portugal, y como era costumbre en los hombres de su círculo social, se unió al ejército a una edad temprana, donde destacó por su espíritu militar.

El dominio adquirió en principio el carácter doble que nunca perdió, en el mar la anarquía de robos, en tierra, el vandalismo sangriento.

En el Reglamento, constaba: «que hiciese en el camino fortaleza en Çofala, haciendo amistad con el jeque local; que partiese de Kilwa para hacer otra, tratando al rey como amigo —enemigo, sólo si se resistiese.

Para este fin, Pêro Ferreira y una tripulación de 80 soldados permanecieron en la ciudad.

En agosto de 1505 los portugueses llegaron a Mombasa, un puerto costero más al norte.

La ciudad, con una población de unos 10 000 habitantes, fue conquistada tras duros combates contra las tropas del jeque árabe local.

Allí se enteró de que los comerciantes portugueses en Quilon habían sido asesinados.

Decidió enviar a su hijo Lorenzo, con 6 barcos, que destruyeron 27 embarcaciones calicut en el puerto de Quilon.

Su muerte fue heroica: herido, sentado en una silla y atado al mástil, condujo a sus hombres hasta que una segunda bombarda acabó con su vida.

En el sabroso lenguaje de los cronistas: En 1509, Almeida se convirtió en el primer portugués en navegar a Bombay.

Su victoria fue decisiva: los otomanos y egipcios dejaron el océano Índico, facilitando el dominio portugués en los siguientes 100 años, hasta el siglo XVII cuando su dominio fue seguido por el de neerlandeses e ingleses.

Gracias a su valor como marino y gobernante iluminado e incorruptible, el dominio portugués en Oriente se tornó completo.

El cuerpo de Almeida fue recuperado en la misma tarde y enterrado en el costero del actual Cape Town.

[5]​ Antônio Barbosa Bacelar (autor fallecido en Lisboa en 1663), escribió su vida en el estilo de Virgilio.

D. Francisco fue elegido para gobernar la India como virrey porque era valiente soldado, hábil almirante, sobre todo estadista.

Pero hizo construir fortalezas en Quilua, Kananor, Andjediva, y aumentar la de Katschi».