[2]​ Entre 1973 y 1974, Raúl Carnese fue Decano de la Facultad de Ciencias Naturales y Museo.

Posteriormente, entre 1998 y 2002 ocupó dicho cargo en la Facultad de Filosofía y Letras, UBA, donde se desempeñó como Profesor Consulto.

[3]​ Junto a Héctor Mario Pucciarelli Carnese creó la Asociación de Antropología Biológica Argentina y la Revista Argentina de Antropología Biológica.

[4]​ Dentro del campo de la antropología biológica, Raúl Carnese se destacó por ser una de las primeras personas en analizar la genética de poblaciones argentinas, tanto pasadas como recientes, y de pueblos originarios como cosmopolitas.

Su actividad estuvo orientada a cuestionar las clasificaciones raciales y el mito de la Argentina blanca.