Francisco Pacheco y Carvajal (siglos XVI-XVII) fue un funcionario español que fue nombrado gobernador de Nueva Vizcaya en 1601 y de Costa Rica en 1602, sin que llegara a asumir ninguno de los dos cargos.
Según algunos autores, nació en Ciudad Rodrigo, Salamanca, hijo de Juan de Mayorga y Ana Pacheco, y pasó a América con el cargo de contador de la Real Caja de Yucatán, aunque es posible que estos datos se refieran a otro individuo del mismo nombre, ya que en ellos no figura con el apellido Carvajal.
En 1598 se encontraba en México y fue comisionado por el virrey de Nueva España don Gaspar de Zúñiga Acevedo y Velasco, conde de Monterrey, para realizar como juez congregador la congregación de los pueblos indígenas ubicados entre los ríos de Alvarado (río Papaloapan) y río de Guaspaltepec (río Tesechoacán), sobre lo cual escribió una interesante relación, publicada en 1600.
Con esos pueblos de creó un corregimiento que comprendió Otatitlán, Tlacojalpan, Chacaltianguis y Tesechoacán, así como Xochiapan, Chilapa y Mixtán.
En su solicitud indica que era soltero y estaba pobre.