Se licenció en 1993 con la memoria "Análisis histórico-jurídico del conflicto árabe-israeli".

Ha desempeñado diversas labores profesionales, como asesorías jurídicas, entre las que destacan las realizadas al senador Sergio Romero Pizarro, entre 1991 y 1993.

Ese año se integró a Empresas Melón S.A, donde posteriormente asumió la Gerencia de Asesorías Legales.

Durante ese período formó parte del Directorio de distintas empresas del Grupo Melón, entre las que se cuenta Grau S.A., Hormigones Premix S.A. y Melón S.A.

En el 2002 fue cofundador de la Plataforma Social Chilena por la Paz que, junto a figuras como Gladys Marín, se opuso a la intervención militar de Estados Unidos en Irak.

Interpuso una denuncia en contra del Estado de Chile ante la Comisión Interamericana de Derechos Humanos para lograr el acceso de enfermos con fibrosis quística al plan Auge, entre ellos el caso de Cony Ossa,[5]​ niña que nació con fibrosis y debió viajar a Italia junto a su padre por más de 7 años para poder llevar a cabo el tratamiento y optar a los medicamentos que la mantuvieran con vida.

En 2014, crea la fundación Vamos que se Puede, cuyo objetivo fue localizar familias vulnerables que necesitaban urgentemente de la intervención para generar un cambio definitivo en sus vidas, contribuyendo a la reducción de la pobreza y la desigualdad en Chile.

Entre 1997 y 1999 fue secretario General Regional de Renovación Nacional en la misma región, pasando a ser presidente distrital de Renovación Nacional para Viña del Mar y Concón.

Para ello renunció a la gerencia legal de Cemento Melón.

Fue uno de los diputados con más asistencia a las sesiones, con 99,54%, y el que más iniciativas legales ingresó a la Cámara en ese período legislativo, con 259 proyectos.

[7]​ Durante su labor como diputado, fue sindicado por un reportaje de Ciper Chile de recibir correos electrónicos por parte del controlador de SOQUIMICH Julio Ponce Lerou con minutas para establecer modificaciones a diferentes leyes medioambientales promulgadas durante el año 2018, las cuales buscaban restarle facultades a la Superintendencia del Medio Ambiente y así favorecer los negocios de la compañía.

[11]​ En julio de ese mismo año, generó polémica declarando en Radio Zero sobre el aborto terapéutico en Chile, defendiendo que el aborto siguiera penalizado en Chile, indicando que esta medida podía facilitar el abuso sexual y las violaciones.

[12]​[13]​[14]​ En noviembre del 2017 fue reelecto por la 6.ª Circunscripción (V región) para el período 2018-2022, con 150 mil votos.

Tras las críticas generada por sus dichos, pidió disculpas mediante sus redes sociales.

[29]​ Ante sus intenciones presidenciales, Mario Desbordes indicó que "Francisco Chahuán ha planteado que quiere ser candidato presidencial en los últimos 15 años y no lo marca en las encuestas.

(...) Por ahora, no marca y eso hace que sea difícil".