Michaux padre crea el primer vivero (jardinería) en Hackensack (Nueva Jersey), New York, y un segundo en Charleston (Carolina del Sur).
En 1801, Michaux hijo es requerido por el gobierno francés para vender las plantaciones que su padre había establecido en Nueva Jersey y en Charleston.
A su retorno, en 1803, pone a punto los registros de su viaje con el título de Voyage à l'ouest des monts Alléghanys dans les États de l'Ohio, du Kentucky et du Tennessée, et retour à Charleston par les Hautes-Carolines... entrepris pendant l'an X (Levrault, Schoell et Cie, Paris, año XII (1804) ; traducido en inglés y en alemán en 1805).
En 1805, publica Mémoire sur la naturalisation des arbres forestiers de l'Amérique septentrionale (Levrault, Schoell et Cie, Paris, año XIII, 1805).
En ruta a Charleston, es prisionero de un navío británico, mas, en la escala en Bermudas, puede circular libremente en la "isla San Jorge".