Conocido por sus papeles cómicos en el programa de televisión Jappening con Ja, y más recientemente, en Paola & Miguelito: la serie.
Realizó su educación secundaria en el Liceo Manuel Barros Borgoño y posteriormente ingresó a la Universidad de Chile donde obtuvo el título profesional de Periodista.
Junto a sus amigos Jorge Pedreros y Eduardo Ravani comenzaron produciendo programas televisivos como Dingolondango (TVN, 1976-1978), hasta que en 1978, crean el exitoso programa humorístico Jappening con Ja que fue emitido por el Televisión Nacional de Chile y luego Megavisión, durante un lapso total de 26 años (1978-2004), con distintos elencos.
En el Jappening, Fernando Alarcón popularizó a personajes como "Canitrot", "Pepito TV", "Ele Jota'", "Segismundo Vega", el "'Licenciado de la Mora", "Alaraco, "y "el Guaripola".
Contrajo matrimonio con la periodista chilena Gemma Contreras y son padres de dos hijos.