Federico IX de Brandeburgo (Brandeburgo, 22 de marzo de 1588-Słońsk, 19 de mayo de 1611), fue Margrave de Brandenburgo, hijo de Juan Jorge de Brandeburgo y de Isabel de Anhalt-Zerbst.

Federico era un miembro de la Casa de Hohenzollern, e hijo del príncipe elector Juan Jorge de Brandeburgo (1525-1598) y de su tercera esposa Isabel de Anhalt-Zerbst (1563-1607), hija del príncipe Joaquín Ernesto de Anhalt.

Fue educado en Frankfurt y Tübingen y emprendió un extenso viaje a través de Europa.

En 1594, fue nombrado coadjutor y luego, en 1610, elegido como Herrenmeister ("Maestre de los Caballeros", equivalente a Gran Maestre) de la Orden de San Juan.

Murió a la edad de 23 años y fue enterrado en la iglesia parroquial de Küstrin.