Luego del descenso y con la llegada de Reinaldo Merlo como entrenador Carrizo no tuvo lugar en el equipo.
Ese año, con Juan Antonio Pizzi jugó la mayoría de los partidos, sin embargo Central no pudo ganarle a San Martín de San Juan en la promoción y no pudo ascender a Primera División.
Pero ante los malos resultados y bajos rendimientos de varios jugadores, desde la fecha 13 ante Douglas Haig comenzó a ser tenido en cuenta por su entrenador.
Ingresó como suplente en la mayoría de los partidos en los segundos tiempos para aprovechar su rapidez cuando los defensores rivales ya estaban cansados.
[3] El 6 de agosto Federico Carrizo fue presentado junto a Andrés Chávez, Jonathan Calleri, José Pedro Fuenzalida, Marcelo Meli y Gonzalo Castellani oficialmente como nuevos jugadores de Boca Juniors, Pachi Carrizo le dieron a portar la camiseta " número 11 " del club.
[5] En la 9º fecha de ese torneo, frente a Quilmes, convertiría su primer gol con la camiseta de Boca, que a la postre, serviría para que el Xeneize gane ese encuentro por 1-0 en la Bombonera.
En ese Torneo Transición 2014, el "Pachi" jugaría todos los partidos, marcando un gol y dando seis asistencias.
Se afianzó como titular del equipo, siendo pieza influyente en la Copa Libertadores 2016, jugando en gran nivel y hasta anotando un gol sobre la hora en La Paz, frente a Bolívar, que decretó el empate 1-1 (una derrota dejaba prácticamente eliminado a Boca).
Un mes después volvería a convertirle al club boliviano en La Bombonera, para el triunfo 3-1.