Al hacerlo, creó las condiciones para intervenir en la lucha interna por el poder bizantino y derrocó al emperador Heraclonas (quien gobernó durante unos meses en 641) por medio de una revuelta, forzando la instalación de su joven sobrino Constante II como emperador del Imperio Bizantino (641–668).

No satisfecho con eso, su padre explicó que la defensa del imperio contra la amenazante expansión del joven Estado Islámico bajo el califa Omar no podía dejarse en manos de un niño emperador, sino que requeriría un general experimentado.

En los años 643/644, el padre de Fausta emprendió nuevas campañas contra la expansión islámica como magister militum per Orientem (maestro del ejército en el este del imperio).

Naturalmente, esto fue un dilema para Fausta, ya que estaba en medio del conflicto entre su padre y su esposo.

[4]​ Sin embargo, fracasó debido a la resistencia del Patriarca de Constantinopla Pablo II y un levantamiento popular contra el usurpador, quien fue asesinado por las masas enojadas en 644.

En los años siguientes, la política imperial fue moldeada por la lucha defensiva contra la expansión del califato islámico, cuando en 644 Uthman ibn Affan, el yerno del profeta Mahoma, de la casa de los omeyas, se hizo cargo de la califato del difunto califa Umar ibn al-Khattab.

Esto, sin embargo, con poco éxito, ya que en los años siguientes perdió Armenia, Chipre y grandes áreas en las provincias al sur y este del mar Mediterráneo.

Fausta vio a su marido con más frecuencia después de 656, porque después del asesinato del califa Uthman el 17 de junio, Bizancio alivió la tensión en este frente.

Sin embargo, el nuevo califa Muawija estaba tan debilitado que tuvo que comprometerse a rendir tributo al marido de Fausta por el momento.

[6]​ También hubo tiempos turbulentos en el área de la política doméstica, cuando en el Imperio Bizantino hubo una violenta disputa entre los monofisitas (doctrina de que Cristo tiene una sola naturaleza, a saber, la divina) y los ortodoxos (Cristo tiene una naturaleza dual según el Concilio de Calcedonia (451), una divina y una humana).

El Papa Martín I escapó de la mutilación, pero fue exiliado a Quersoneso (en Crimea) y murió allí unos años después.

[8]​ En 652, diez años después de su matrimonio, Fausta dio a luz a un hijo que llamaron Constantino, heredero al trono y más tarde emperador Constantino IV, y más tarde a sus hermanos Heraclio y Tiberio, que fueron nombrados co-emperadores en 659.

Fausta y los niños debían seguir el deseo del emperador hasta Sicilia.