Esta bula papal fue confirmada por otra concedida en 1508, en la que ya se contemplaba la enseñanza de Artes, Lógica, Filosofía, Teología, Derecho Canónico y Civil y Medicina.

[4]​ No es hasta el año 1518 cuando podemos considerar que se comienzan a impartir los estudios de Derecho quedando estos repartidos en una Facultad de Cánones, compuesta por tres cátedras, en las que se explicaba el Corpus iuris canonici (Decretum y Decretales), y una Facultad de Leyes, con tres cátedras igualmente, donde, además de Retórica, se explicaba el Corpus iuris civilis (Instituta, Codex y Digesta).

Durante los siglos siguientes se otorgaron diferentes Estatutos que delimitaban las competencias de la Universidad, el Colegio Santa María de Jesús y el poder real.

Este proceso fue en aumento hasta su culminación en 1771 cuando se produce la separación definitiva del Colegio y la propia universidad.

La nueva concepción del Derecho como elemento sustancial para la ordenación de la realidad social hace que se impulsen numerosos planes de estudios jurídicos en la Facultad.