Al F2 se le ha relacionado con casos de desaparición forzada, limpieza social, así como asocio con paramilitares y narcotraficantes, entre otros.
En 1969 se creó el Laboratorio de Criminalística, el cual le sirvió al F2.
En 1971, el F2 se convirtió en la División de Información, Policía Judicial y Estadística Criminal (DIPEC) adscrita al Ministerio de Defensa, conservando su denominación F2 hasta su transformación.
En 1983, mediante el Decreto 2137 el CIC fue elevado a la categoría de Dirección, denominándose Dirección de Policía Judicial e Investigación (DIJIN).
Finalmente, en 1995 la DIPEC desapareció y sus tareas de inteligencia e investigación se dividieron entre la nueva Dirección de Inteligencia Policial (DIPOL) y la DIJIN, unidad que para esta transformación se renombró Dirección de Investigación Criminal (DIJIN).