Debutó como profesional con el equipo portugués de 2.ª división Paredes, en el año 1999, donde permaneció cuatro temporadas.

En la misma logró imponerse en la penúltima etapa, con final en la Bola del Mundo tras un largo ataque buscando ganar la ronda española, ocupando la segunda posición de la clasificación general final a 41 segundos del italiano Vincenzo Nibali.

[4]​ En 2011 fichó por el equipo Vacansoleil-DCM Pro Cycling Team, donde Mosquera iba a coincidir con el italiano Riccardo Riccò, que ese año volvía a competir tras una sanción de dos años por dopaje y quien, tras un primer debut con el Ceramica Flaminia, había fichado por el equipo neerlandés.

[7]​ Durante el 2012 Mosquera hizo unas declaraciones insinuando que podría haber incumplido alguna norma antidopaje aunque no dejando clara su culpabilidad.

[4]​ 2005 2008 2009 2010 2010 Durante su trayectoria deportiva consiguió los siguientes resultados en grandes vueltas ciclistas y en los Campeonatos del Mundo de Ciclismo en ruta: ―: no participa Ab.