[9]Entre 2006 y 2007, los hámsteres sirios representaron el 19% del total de participantes en investigaciones con animales en los Estados Unidos.
[12] Si bien los ratones, las ratas y otros roedores son, con diferencia, los animales más utilizados en la investigación biomédica, estudios recientes han puesto de relieve sus limitaciones.
[13] Por ejemplo, varios investigadores han puesto en duda la utilidad del uso de roedores para detectar sepsis,[14][15] quemaduras,[15]accidente cerebrovascular,[16][17] esclerosis lateral amiotrófica,[18][19][20] Alzheimer,[21] diabetes,[22][23] cáncer,[24][25][26][27][28] esclerosis múltiple,[29] enfermedad de Parkinson[29]y otras enfermedades.
Además, las infecciones virales persistentes (por ejemplo, los herpesvirus) se activan en humanos, pero no en ratones SPF, con complicaciones sépticas y pueden cambiar la resistencia a las coinfecciones bacterianas.
[14] Un artículo en The Scientist señala: "Las dificultades asociadas con el uso de modelos animales para enfermedades humanas resultan de las diferencias metabólicas, anatómicas y celulares entre los humanos y otras criaturas, pero los problemas son incluso más profundos que eso", e incluyen cuestiones con el diseño y la ejecución de las pruebas mismas.
Al alojar a los roedores en condiciones de extrema pobreza, estos animales cautivos tienen un parecido reducido con los humanos o sus congéneres salvajes.
[33] Algunos estudios sugieren que la publicación inadecuada de datos sobre pruebas con animales puede dar lugar a investigaciones irreproducibles, con detalles faltantes sobre cómo se realizan los experimentos omitidos en los artículos publicados o diferencias en las pruebas que pueden introducir sesgos.
[5][34][35] Otro estudio de 2016 sugirió que los microbiomas intestinales en ratones pueden tener un impacto en la investigación científica.