Fue acusado de ateísmo y murió quemado en la pira junto a sus libros.Etienne Dolet recurrió entonces ante el Parlamento de París, finalmente gracias a la intervención del obispo Pierre Duchatel, se le concedió la libertad.Ingenuamente pensó que podía volver a Lyon para defenderse pero, cuando regresó, fue detenido y llevado a París, y después de dos años, condenado a muerte por blasfemia, sedición y por impresión de libros prohibidos.No se sabe si Dolet debe ser clasificado entre los representantes del protestantismo, o entre los defensores de un anti-racionalismo cristiano.Su crimen fue, según algunos, haber profesado el materialismo y el ateísmo, y según otros, haberse mostrado favorable a las opiniones de Martín Lutero.
