A lo largo de su historia, ha sido una universidad multidisciplinaria integrada, posteriormente un conjunto de universidades especializadas independientes y, recientemente, las unidades independientes se han vuelto a unir en una asociación de instituciones dedicadas a la enseñanza y la investigación.

Comprende diversas instituciones, entre ellas las tres en las que se dividió en 1968 la antigua Universidad de Toulouse, la segunda universidad más antigua del país por detrás de la Universidad de París, que volvieron a unirse en 2007 para dar lugar al actual complejo.

Al final del Segundo Imperio, marcada por una mala situación de las universidades francesas salvo en su capital, surgen cuatro facultades en Toulouse: Ciencias de Derecho, Humanidades, Ciencias Naturales y Teología Católica.

En el año 2007 volvieron a reunirse las tres universidades en una única institución junto con otros centros de enseñanza e investigación, aunque manteniendo un régimen más descentralizado al precedente a su separación en 1968.

La Universidad de Toulouse I Capitole imparte las enseñanzas en derecho, economía y ciencias políticas.