Es el tipo de relación que, por ejemplo, debe esperarse entre una oración activa y su forma pasiva.
La estructura profunda es abandonada en el programa minimalista al descartarse la concepción representacional de la gramática por un modelo derivacional sin niveles internos.
Técnicamente la estructura profunda de principios y parámetros coincidiría con el primer estado del proceso derivacional que lleva a la forma realmente pronunciada (que sería similar a la estructura superficial).
En la teoría estándar, la estructura profunda se deriva de las reglas presentes en el subcomponente base del componente sintáctico.
A diferencia del modelo estándar, rección y ligamiento asigna interpretación semántica sobre la estructura-S (la estructura superficial renombrada), dejando como única función para la Estructura-P el ser la representación sobre la que se realizan los desplazamientos de constituyentes.