[1]​ Al este del estrecho está la isla de Taiwán y en el centro se encuentra el pequeño archipiélago de las islas Pescadores o Penghu.

Dentro del estrecho se encuentra Penghu o las islas Pescadores, también controlados por la ROC.

Hay un importante banco submarino a 40-60 km (25-37 mi) al norte de las islas Penghu.

[8]​ La línea media fue definida en 1955 por el general de la Fuerza Aérea estadounidense Benjamin O. Davis Sr. que trazó una línea en el centro del estrecho; Estados Unidos presionó entonces a ambas partes para que llegaran a un acuerdo tácito de no cruzar la línea media.

Un gran número de Archaeopteryx y arqueozoos emigraron a Taiwán desde China continental a través del estrecho de Taiwán, que se convirtió en tierra firme.

La formación inicial del estrecho comenzó durante los períodos Cretácico y Paleoceno, es decir, hace 54 millones de años, cuando la parte central de Taiwán comenzó a inundarse de agua, convirtiéndose en un mar poco profundo en el centro, y empezando a convertirse en un estrecho.

Existen evidentes variaciones estacionales en las corrientes del Estrecho de Taiwán, siendo el invierno dominado por las corrientes costeras de norte a sur, y el verano dominado por las aguas cálidas de sur a norte y los afluentes Kuroshio del Océano Pacífico.

La exploradores europeos, principalmente los portugueses, los españoles y los holandeses, también aprovecharon el estrecho para establecer bases de avanzada para el comercio con el continente durante la Ming; las bases también se utilizaron para la piratería tanto a la costa china como a los barcos comerciales de países rivales.

Dorgon y el emperador Kangxi lograron consolidar su control sobre el sur de China continental; Koxinga se vio limitado a realizar incursiones a través del estrecho.

Durante muchos años, los contactos entre ambos lados del estrecho estuvieron totalmente prohibidos por los dos regímenes enfrentados.