El estrecho conecta la bahía Suisun, que recibe las aguas del estuario de los ríos Sacramento y San Joaquín, con la bahía de San Pablo, la extensión norte de la bahía de San Francisco.

En 1985, una ballena jorobada nadó hacia el estrecho de Carquinez hasta el río Vista.

Llamada por los medios de comunicación Humphrey, se convirtió en todo un suceso, siendo rescatada después por el Centro de Mamíferos Marinos y otros voluntarios.

El estrecho lleva el nombre de los karkin ("los carquines", en español), una división lingüística de los nativos americanos ohlone que residía a ambos lados del estrecho.

UU. y mercantes de la reserva.