La estación de Frauenfeld fue abierta en el año 1855 con la apertura al tráfico ferroviario de la línea que unía a Winterthur con Romanshorn, del Schweizerische Nordostbahn (NOB), y en 1902 se integró en los SBB-CFF-FFS.

En el año 1887 fue inaugurado el ferrocarril de vía métrica Frauenfeld–Wil-Bahn que unía a la ciudad con Wil, y finalizaba su recorrido en la plaza de la estación.

La estación se encuentra ubicada en el centro del núcleo urbano de Frauenfeld.

Tiene dos andenes, uno central y otro lateral, a los que acceden tres vías pasantes.

Además existen otras dos vías pasantes más y un pequeño depósito en el norte de la estación.