La estación de Flüelen fue inaugurada en el año 1882 con la puesta en servicio al completo de la línea Immensee - Chiasso, más conocida como la línea del Gotardo.
Se encuentra ubicada en el centro del núcleo urbano de Flüelen.
Cuenta con dos andenes, uno central y otro lateral, a los que acceden tres vías pasantes.
A ellas hay que sumar una vía pasante más y varias vías muertas.
En términos ferroviarios, la estación se sitúa en la línea Immensee - Chiasso.