La estación de Mendrisio fue inaugurada en el año 1874 con la puesta en servicio del tramo Lugano - Chiasso de la línea Immensee - Chiasso, más conocida como la línea del Gotardo, que se inauguraría al completo en 1882.

Se encuentra ubicada en el suroeste del núcleo urbano de Mendrisio.

Cuenta con tres andenes, dos centrales y uno lateral, a los que acceden cuatro vías pasantes.

En términos ferroviarios, la estación se sitúa en la línea Immensee - Chiasso.

Sus dependencias ferroviarias colaterales son la estación de Capolago-Riva San Vitale hacia Immensee y la estación de Balerna en dirección Chiasso.