Fue cabecera del ramal Pelequén-Las Cabras hasta 1983 cuando paralizan sus viajes.Producto de dicha tragedia la estación fue clausurada y no se realizaban detenciones de los servicios en el lugar.Fue reinaugurada el 18 de julio del 2001, para el servicio Metrotren.[9] El 19 de agosto de 2022 el presidente Gabriel Boric anunció nuevas detenciones del Tren Rancagua en el tramo Rancagua–San Fernando, para ello se volverá a habilitar la estación Pelequén.Se espera que la estación vuelva a estar operativa en 2025, junto con las estaciones Requínoa y Rosario.
Pictograma que identificaba a la estación en 2001.
