Nació en Austria en el seno de una familia burguesa.Estudió en la Universidad de Viena, donde alcanzaría posteriormente el doctorado.[4]Con motivo de esta dedicatoria, fue descrito en la prensa vienesa de la época comoun estadista por cuya rara humanidad, unidad y alto nivel de rectitud ha logrado en nuestro país reconocimiento y respeto general.[5]Durante la Revolución de 1848 en Austria que elevó al trono a Francisco José I y exilió al canciller Metternich, Niebauer no tuvo un comportamiento leal a este último, de acuerdo con los diarios de Melania tercera esposa de canciller.Contrajo matrimonio con Marie Mozart, teniendo el matrimonio al menos tres hijos: Fue objeto de un retrato, junto a su mujer, por Leopold Bucher.
Escudo de armas otorgado con motivo de su ennoblecimiento (1841)
El edificio de la Cancillería en Viena, en que trabajó Ernst durante la mayor parte de su vida.
