Enrique II era el hijo mayor del margrave Enrique I de Baden-Hachberg y su esposa, Inés, una hija del conde Egino IV de Urach.

Poco después, construyó el castillo de Sausenburg, que es mencionado por vez primera en 1246.

[1]​ Tuvo disputas con los gobernantes espirituales de la zona y con los condes de Friburgo sobre los complicados derechos y privilegios que tenían (o pretendían tener) cada uno sobre las posesiones del otro.

Enrique II cogió algunas de estas tierras y logró redondear su territorio.

Durante la guerra contra Bohemia, Enrique II compartió del lado imperial en la decisiva Batalla de Marchfeld.