Fue educado en la Universidad de Viena (MD, 1874) y fue un alumno admirador de Josef Hyrtl,[1] y asistente anatómico de Karl von Rokitansky (1804 -1878) y Karl Langer (1819-1887).
En 1875 se convirtió en profesor titular de anatomía en la Universidad de Utrecht, y fue nombrado profesor asistente en la Universidad de Viena en 1879, llegando a ser profesor en Graz en 1882.
Realizó investigaciones en casi todos los campos de la morfología, haciendo contribuciones a la anatomía normal y patológica de la cavidad nasal, la anatomía del esqueleto facial, los vasos sanguíneos, el cerebro, el sistema cromafín, et al.
[2] La casa de la pareja fue un lugar de encuentro para las vanguardias en las artes y la ciencia; entre sus invitados se incluían el escultor Auguste Rodin (1840-1917), el pintor Gustav Klimt (1862-1918), el arquitecto Otto Wagner (1841-1918), el escritor Hermann Bahr (1863-1934), el dramaturgo Arthur Schnitzler(1862-1931) y el compositor Gustav Mahler (1860-1911).
[3] Zuckerkandl contribuyó con muchas monografías en revistas médicas, entre ellas: