Según Lawrence S. Stepelevich, Edgar Bauer fue el más anarquista de los jóvenes hegelianos y "... es posible discernir, en los primeros escritos de Edgar Bauer, la justificación teórica del terrorismo político".
Otros miembros de su círculo fueron Arnold Ruge, Karl Marx, Max Stirner, Friedrich Engels, Georg Herwegh, Karl Grün, Moses Hess y Mikhail Bakunin.
No siguió el "giro materialista" en la filosofía del joven hegeliano inaugurado por Ludwig Feuerbach (como lo hicieron Marx, Engels, Grün y otros), sino que se mantuvo fiel a la "filosofía de la acción" idealista neofichteana propagada por su hermano Bruno.
Cuando Bruno Bauer fue despedido de su cargo académico por su ateísmo, quedó claro para Edgar que, dada la reputación de su hermano y su propia trayectoria creciente como publicista radical, una carrera académica estaba cerrada para él.
Reanudaron el ataque en La ideología alemana (1846), que no se publicó en ese momento.
A pesar de esto, Edgar Bauer parece haber mantenido una relación amistosa con Marx y Engels.