El Doctor Manhattan apareció más tarde en la precuela del cómic Before Watchmen.
Moore buscó profundizar en la física nuclear y la mecánica cuántica al construir el personaje del Doctor Manhattan.
[4] Gibbons quería representar con buen gusto la desnudez de Manhattan, seleccionando cuidadosamente cuando estaba de frente se producirían disparos y le darían genitales "discretos", como una escultura clásica, para que el lector no lo notara inicialmente.
Aquí conoce a Janey Slater, una compañera investigadora; finalmente se convierten en amantes.
Los investigadores de afuera no pueden abrir la puerta o anular la cuenta regresiva, y la fuerza del generador hace pedazos a Jon.
Declara que su sencillez enciende su respeto; en consecuencia, quema sin dolor la marca en su frente.
Toda la trama de Watchmen ocurre durante la cuenta atrás para una guerra nuclear.
Él es el único responsable del cambio a los vehículos eléctricos, y Adrian Veidt le atribuye haber causado un gran salto en una miríada de sectores de la ciencia y la tecnología.
Durante la única reunión del grupo Crimebusters, Manhattan se siente atraída por Laurie Juspeczyk, la segunda Silk Spectre.
UU., Manhattan está exento de una ley federal que prohíbe a los héroes disfrazados.
Poco tiempo después, Manhattan asiste al funeral de Blake con Veidt y Dreiberg.
Reflexiona sobre su asociación con Blake durante la guerra de Vietnam y siente la presencia del antiguo villano, Moloch.
Manhattan está asombrado por los eventos improbables que ocurrieron para dar como resultado el nacimiento de Laurie, una cadena de eventos que él ve como un sorprendente "milagro termodinámico".
Al ver que el plan de Veidt ha evitado la guerra, Manhattan se da cuenta de que exponerlo sería demasiado peligroso para la vida en la Tierra y acepta permanecer en silencio.
Sin embargo, esas acciones no obtendrían el resultado esperado y conducirían a la creación de The New 52.
[7] La fusión le permitió borrar diez años del universo revertido, lo que no solo revirtió la edad de sus habitantes en diez años, sino que también provocó las múltiples resurrecciones de varios personajes fallecidos.
[10] Sin embargo, la Convergencia causada por Brainiac y Telos restauró el Multiverso, recuperando la línea de tiempo anterior a Flashpoint.
Sin embargo, Wally West fue salvado por Barry, iniciando así los eventos de DC Rebirth.
Cuando Thawne levanta el botón, es teletransportado brevemente y regresa con la mitad izquierda de su cuerpo carbonizada hasta los huesos.
[23] El Doctor Manhattan recuerda varios eventos en los que mató indirectamente a Alan Scott y, por lo tanto, provocó cambios en la línea de tiempo.
y no deja familia atrás, ya que la linterna verde pasa por diferentes lugares.
Regresa a Marte, reflexionando sobre una visión ambientada un mes en su futuro: un enfrentamiento con Superman, eso puede resultar en que Superman destruya al Doctor Manhattan o que el Doctor Manhattan destruya todo.
Sin embargo, los superhéroes observan conmocionados cómo el Doctor Manhattan se reconstituye antes de atacarlos e incapacitarlos.
Luego, se lleva al hijo pequeño de Mime y Marionette con él y procede a criarlo solo, por lo que se convertirá en el equivalente de Superman en su planeta.
Su último pensamiento se dirige a lo que podría haber sido su vida si no se hubiera convertido en el Doctor Manhattan: Janey lo convence de que no recupere el reloj para que no se vea involucrado en el incidente que le habría dado sus poderes; se casa con Janey y forman una familia juntos, tienen dos hijas y un hijo, viviendo una vida sin preocupaciones por el tiempo.
Deja al niño, a quien ha llamado Clark, para que sea adoptado por Nite Owl y Silk Spectre.
Batman Who Laughs pudo capturar esta alternativa y extraer su cerebro antes de que pudiera aprovechar adecuadamente sus poderes, lo que le permitió a Batman Who Laughs trasplantarse a sí mismo en el cuerpo, transformando al villano en "The Darkest Knight" para crear un Multiverso que consiste en el caos.
Es capaz de alterar su tamaño según sus necesidades, por ejemplo, reconstruyéndose en una forma mucho más grande.
También es capaz de manipular la realidad como mejor le parezca mediante el uso de la manipulación del tiempo, como se vio cuando borró diez años del Universo DC, cuando Barry Allen intentó que su universo original volviera a la normalidad.
En Crisis final # 2, el exiliado Monitor Nix Uotan dibuja un personaje que se parece al Doctor Manhattan.