Por su obra, es considerado el padre de la inmunología clínica mexicana.

Obtuvo una maestría en medicina interna en la Universidad de Minnesota en 1968.

[2]​ Se integró como investigador en el Instituto Nacional de Nutrición, creó el Departamento de Inmunología y Reumatología, llegó a ser director general del instituto de 1992 a 2002, durante su gestión cambió el nombre a Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán.

Fue fundador y presidente del Consejo Mexicano de Reumatología en 1982.

[3]​ Durante su trayectoria profesional recibió más de cuarenta premios y distinciones, entre ellos destacan:[4]​ Fue su padre el doctor Donato G. Alarcón Martínez.