Debido a que el nuevo jefe, Mijaíl Súslov, tenía otras responsabilidades, Shepílov tuvo prácticamente el control completo de las operaciones diarias del Departamento.

Ya en Moscú, Shepílov –famoso por su memoria fotográfica, erudición y formas educadas- se convirtió en un experto sobre la ideología comunista y en protegido del jefe del aparato ideológico de Iósif Stalin, Andréi Zhdánov.

Tras la muerte de Stalin en marzo de 1953, Shepílov se convirtió en aliado y protegido del nuevo líder soviético, Nikita Jrushchov, administrándole apoyo ideológico en la posterior lucha contra el primer ministro Gueorgui Malenkov.

En julio de 1955, Shepílov viajó a Egipto para entablar negociaciones con el presidente Gamal Abdel Nasser y cerrar un pacto armamentístico, lo que significaba el reconocimiento de facto del régimen egipcio y abría el camino para una consiguiente alianza soviético-egipcia.

Abandonó su puesto en el Pravda, aunque permaneció como Secretario del Comité Central hasta el 24 de diciembre.

Sin embargo, una vez la decisión de convocar la conferencia fue firme, lideró la delegación soviética a la misma.

Aunque la conferencia adoptó la resolución estadounidense sobre la internacionalización del Canal de Suez por 18 votos contra 4, Shepílov tuvo éxito en alcanzar una alianza con la India, Indonesia y Sri Lanka, objetivo marcado por la dirección soviética.

Se unió al golpe del conocido como Grupo Anti-Partido en el último momento, cuando Lázar Kaganóvich le aseguró que los conspiradores tenían mayoría en el Politburó.

Cuando Jrushchov prevaleció ante el pleno del Comité Central, se mostró furioso sobre la traición de Shepílov.

Fue cesado del Comité Central el 29 de junio y vilipendiado en la prensa junto a Mólotov, Malenkov y Kaganóvich, los otros únicos dirigentes soviéticos cuya participación en el intento de golpe fue hecha pública en aquel momento.

Sus documentos se perdieron tras su muerte a los 89 años en Moscú, aunque fueron encontrados y publicados en 2001.