[2] Las últimas lápidas en dos cementerios siríacos orientales descubiertas en Mongolia a fines del siglo XIX datan de 1342, y varias conmemoran muertes durante una plaga en 1338.
Es posible que varias diócesis siríacas orientales en Irak fueran destruidas durante las salvajes campañas de Tamerlán en Asia occidental entre 1380 y 1405.
En ʿIlam, la diócesis metropolitana de Jundishapur (mencionada por última vez en 1318) y las diócesis de Susa y Shushter (mencionadas por última vez hacia finales del siglo XIII) también pueden haber llegado a su fin en este período.
Durante los siglos XIV y XV también hubo una diócesis metropolitana para una comunidad de comerciantes siríacos orientales en Chipre.
Esta comunidad se vio sometida a una fuerte presión por parte de la Iglesia latina, y la diócesis decayó después de que el metropolitano Timoteo se convirtiera al catolicismo en 1445.
En el oeste había pequeñas comunidades siríacas orientales en Jerusalén, Alepo y Chipre, pero sin obispos.
En 1490 dos cristianos de Malabar llegaron a Gazarta para solicitar al patriarca Shem ʿon IV que consagrara un obispo para su Iglesia.
Dos monjes del monasterio de Mar Awgin fueron consagrados obispos y enviados a la India.
Su sucesor, Eliya V, consagró tres obispos más para la India en abril de 1503.
Eliya ya había muerto cuando esta carta llegó a Mesopotamia, y fue recibida por su sucesor, Sem ʿon VI (1504-1538).
Se dice que el patriarca Shem ʿon VII Isho ʿyahb confió la administración de algunas diócesis vacantes a laicos y consagró a dos sobrinos como metropolitanos, de doce y quince años respectivamente, presumiblemente porque no había parientes mayores disponibles.
Para entonces, Nísibis era poco más que una aldea y el futuro del cristianismo siríaco oriental en la región estaba en las comunidades caldeas establecidas recientemente en las ciudades de Amida (actual Diyarbakır) y Mardin.
Un metropolitano llamado Timoteo se menciona en el colofón de un manuscrito copiado en 1429/1430.
Inusualmente para un metropolitano de Nísibis, su título también incluía a Amida y Mardin, los cuales tenían obispos católicos consagrados por Sulaqa, y probablemente fue consagrado por Shem ʿon VII Isho ʿyahb en respuesta al fuerte desafío católico montado por Sulaqa en los distritos occidentales.
[16] Quizás deba identificarse con el obispo Yohannan 'de la fortaleza de Atel' que fue quemado en la hoguera en Amida en 1572.
Esta comunidad se dispersó pocas décadas después de la captura de la ciudad por los turcos en 1571, pero todavía se puede ver en Famagusta una hermosa iglesia nestoriana del siglo XIV, construida en estilo provenzal por el rico príncipe comerciante Francis Lakhas.