Durante la Reforma protestante del siglo XV, Osnabrück no se puso completamente del lado de los católicos, pero tampoco abrazó el protestantismo.

El territorio pasó a Prusia en 1806, al Reino de Westfalia en 1807, al Imperio napoleónico de Francia en 1810 y nuevamente a Hannover en 1814.

La misma bula, reconocida por la ciudadanía, impuso temporalmente una unión in persona episcopi con la diócesis de Hildesheim, pero el obispo sería representado en la ciudad de Osnabrück por un vicario general y un obispo auxiliar durante los siguientes treinta años.

En 1910 se realizó un censo: 12 decanatos, 108 parroquias, 153 estaciones pastorales, 271 sacerdotes del clero secular y 12 del clero regular, con un total de 204 500 católicos.

Las únicas comunidades religiosas masculinas eran la de los capuchinos que tenían un convento en Klemenswerth y una Escuela Apostólica Marista en Meppen.

Las órdenes religiosas femeninas incluían benedictinas, borromeas, franciscanas, ursulinas y otras.

En 1866 el territorio de la diócesis pasó, con Hannover, a Prusia; Melchers se convirtió en arzobispo de Colonia y en el mismo año le sucedió John Henry Beckmann (1866-1878), por lo que tras una sede vacante que duró cuatro años la silla episcopal pasó a manos de Bernardo Höting (1882-1898).