La diócesis de Arua (en latín: Dioecesis Aruaënsis y en inglés: Roman Catholic Diocese of Arua) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Uganda.
La diócesis tiene 10 562 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en los distritos de Koboko, Yumbe, Moyo, Adjumani, Maracha-Terego y Arua en la región Septentrional.
La sede de la diócesis se encuentra en la ciudad de Arua, en donde se halla la Catedral del Sagrado Corazón.
En Lodonga se encuentra la basílica de la Santísima Virgen María.
Según el Anuario Pontificio 2021 la diócesis tenía a fines de 2020 un total de 2 436 600 fieles bautizados.