Con semejante tecnología y recursos a su disposición, Zaarin era uno de los vasallos más poderosos del Emperador Palpatine.
Sin embargo, justo cuando Darth Vader concluyó con la traición del Almirante Harkov, Zaarin lanzó un golpe de Estado, intentando secuestrar al Emperador y llevarlo a su nave insignia, el Gloria.
Justo antes de que Zaarin pudiera escapar, el vicealmirante] Thrawn llegó para apoyar a lord Vader y su flota.
Tras esto, comenzó una guerra interna del Imperio en la que Thrawn se dedicó a perseguir al Gran Almirante desertor por toda la Galaxia.
Sus planes de convertirse a sí mismo en el nuevo dictador habían fracasado, y con los oficiales de mayor talento del Imperio pisándole los talones, tuvo que retirarse al Borde Exterior, saqueando planetas y destruyendo bases que se interponían en su camino.